最近拿到一个植物基因组的三代和二代测序数据,想通过以三代测序数据为主,二代测序数据为辅的方式学习一下如何拼接组装一个基因组。但是三代测序数据刚到手就懵了,与之前学习的转录组分析不一样,三代测序返回的几个文件不是单纯的fq文件,于是我又开始恶补了一些三代测序的基础知识,开坑写个三代基因组测序组装的系列笔记~
接触过生物学的小伙伴对NCBI在线BLAST网页一定不陌生,简单介绍一下这个网页的5种比对工具:blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx,以及如何进行本地建库和blast比对。
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