之前说到如何对三代测序数据做污染评估，取随机序列做blastn比对nt库，确定物种分布情况。实际blast比对还要考虑比对的序列长度和ONT本身数据错误率，以及结合GC-depth确定是否有污染。基因组三代测序数据组装之前，我们还要做一个全基因组survey。主要是为了减少盲目性，先做低深度的基因组分析，也是初步了解物种基因组特征的有效方法，比如评估基因组大小和杂合情况，为后续全基因组de novo组装策略指定提供指导。