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本篇笔记主要记录如何在linux命令行中用TASSEL5PLINK2软件做GWAS分析,以及如何可视化GWAS结果(在R中绘制曼哈顿图和QQ图)。关于GWAS是做什么的,以及基本概念介绍可以看上一篇笔记介绍:群体基因组学——概述和图表详解 - 我的小破站 (shelven.com)