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注释得到的基因集中，可能某些基因存在被转座子插入的情况，该基因会在后续功能注释的时候被注释上，但实际在基因组中该基因可能已经被插入失活。因此在基因组的功能注释前，需要用检测转座子软件（如TransposonPSI、TEsorter等）将含有转座子的基因找出并去除。