前几天老师布置了一个任务,寻找夹竹桃科Apocynaceae分类下的物种参考基因组,我在plaBiPD网站和NCBI的genome数据库中只找到包括罗布麻在内的5个已发表物种参考基因组,且都是gbff格式的。提交之后被告知需要gff格式的,因为gbf格式中没有基因相关结构的位置信息。找了一个perl脚本完成了任务。
前几天老师布置了一个任务,寻找夹竹桃科Apocynaceae分类下的物种参考基因组,我在plaBiPD网站和NCBI的genome数据库中只找到包括罗布麻在内的5个已发表物种参考基因组,且都是gbff格式的。提交之后被告知需要gff格式的,因为gbf格式中没有基因相关结构的位置信息。找了一个perl脚本完成了任务。