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这两个月经历了突然的疫情隔离,研究生开题,学术论坛,研究生创新项目等等……终于在这一周尘埃落定了,得以静下心来整理整理自己的一些学习笔记。之前我用过一些python编写的项目,我也只是依葫芦画瓢或者在demo上直接改,还没有系统性地学习过这门编程语言。这里就再记录下自己自学python的一些入门时的笔记,以及记录下几个机器学习方面的python库的使用方法。

做完基因组三代测序数据质控之后,我们把所有reads的Q值控制在7以上,每个read的长度在1000bp以上。我们不能明确自己的测序数据是否被其他物种污染,这个时候就要用balst比对的方法确定测序数据是否被污染,以及污染的来源。

捣鼓了几天python代码,我现在也越来越发现python的魅力所在,它的强大之处在于有非常多的第三方库可以随意调用。我不需要知道这些第三方库各种函数的实现方式,只要知道这些函数有什么作用,能得到什么结果。只要构思好自己的想法,找到对应的库就可以一步步按照我的思路编写程序,实现我想要的结果,整个构思到实现的过程让我非常愉悦~

写的这个小爬虫程序主要是应用requests库和lxml包的etree库,简单介绍一下。

最近在自学python,刚入门苦于不知道从何下手,也不知道用什么编辑器比较适合。在度娘上搜了十几款编辑器,最终决定用微软的vscode,这个编辑器可以配置Python、Java、C ++等编程环境,而且有非常强大的插件功能,界面看着也挺友好,写个日志记录下自己瞎捣鼓的配置。