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IGV（Integrative Genomics Viewer）是一个非常方便的比对软件，在使用前只需要将参考基因组和bam文件分别建立索引（即建立fai和bai文件）并载入，就可以对转录组测序数据进行可视化浏览。对比samtools tview功能，这个软件有交互式操作界面，对萌新非常友好。